第三次忍界大战已经开打了。
第二次忍界大战，让五大国的统治力量减弱，周边小国以为机会来临，开始发生动乱和侵略战争，战火逐渐蔓延到了整个世界，这对背负着战斗命运的忍者们来说，战乱时代的到来就意味着悲伤的开始……
激烈的摩擦开始在各个国家的边境线不断地上演着，然后就是忍者大军的到来。
谁都没想到第一个大动干戈的还是岩隐村。
岩隐忍者大军率先突破了草隐忍者村，抵达了火之国的边境线附近。
这个时候的木叶村在第三代火影的带领之下繁荣的发展，木叶隐村得到这个消息之后立刻派出精锐部队迎击，但还是遭到具有人数优势的岩隐村部队的猛攻，战况岌岌可危。
与此同时，云隐村的忍者大军也开始向边境集结，目标直指火之国，声称：要让木叶为当年的八尾暴乱付出代价。
领头的人正是雷影候补人艾以及他的搭档，新一代八尾人柱力奇拉比，AB组合正式登上战争舞台。
此时的奇拉比已经完美的掌握了八尾的力量，再也不是以前的人柱力那样天天担心尾兽暴动，相反，八尾成了奇拉比最大的帮手。
‘杀人蜂’的名声也被传开，凭借‘荒缲鹭伐刀’这个A级体术，奇拉比在近战的情况下可以同时使用七把快刀将敌人杀死，诡异至极，让人防不胜防，就算是同样以速度著称的波风水门，也别想在反应力上面快过他。
然而事情远远没有结束，就在同一年，风之国砂隐村发生了一件让所有人都想不到的事情，号称历代最强的三代风影失踪了。
这个消息太突然了，藏都藏不住，三代风影可是公众人物，一天不露面都让人觉得不可思议，砂隐村派出了无数的人找了几个月都没有头绪，由于找不到尸体，也为了最后一点颜面，砂隐村将其判定为失踪。
砂隐村这个时候失踪的可不止三代风影一个，千代的孙子‘蝎’也在这个时候失踪了，一个还不满十五岁的少年傀儡师，大家也没有往他身上想，毕竟是千代的孙子，没有证据可不能怀疑他，而且也不认为他的失踪跟三代风影有关，双方实力相差实在太大。
在风影失踪的大背景下，‘蝎’的情况实在算不上什么事，这件事情很快就被战争淹没了。
砂隐村怀疑这件事情跟岩隐村脱不开关系，两个村落相互之间有很大的仇恨，于是集结大军准备和岩隐开战。
另外雾隐村和砂隐村也有剧烈摩擦，冲突不断，紧急上位的罗砂为了能够专心对付岩隐村，于是谋求跟雾隐缓和关系。
雾隐村此时还没有正式参战，由于地理位置的原因，孤悬海外岛屿之上，可以说没有人对他们有兴趣，它不主动参战别人也不会招惹它，不过雾隐村也在积极备战，只是需要一个合适的时机而已，第三次忍界大战这么热闹的场面，利益瓜分，不能错过。
木叶此时面临双线作战，敌人的实力异常强大，不能不谨慎对待，两边的战况都非常激烈，此时‘木叶三忍’已经彻底成长起来，足以担当大任。
木叶村高层决定由自来也和纲手姬统帅大军对战岩隐村忍者部队，由大蛇丸统帅另一支大军对战云隐村，波风水门作为先锋部队大队长迎战AB组合。
战争是残酷的，战争意味着死亡，同时也有实力强大的忍者在战场上闯出了名声，这其中最有名的就是木叶的黄色闪光，云隐的AB组合，以及砂隐的灼遁叶仓，都是在战场上杀出来的名声。
天一匆匆忙忙的赶回村子向三代火影报道，因为战事不利，村子牺牲了很多忍者，现在可以说是急需补充，天一回来得是晚了一些，不过总算是赶上了。
三代一点责备的意思都没有，急急忙忙的就给他安排任务，前线实在是太缺人了，尤其是三代看出来天一经过这几年的修行，实力大增，身上无意间流露出来的气机已经是稳稳的精英上忍了。
时间紧迫，天一也没办法在家里多待，千手玲子这段时间也忙了起来，不像以前那样有时间了，不过还是请假跟儿子聚了半天，家人团聚的时间幸福而又短暂，转眼就到了第二天，天一要奔赴战场了。
这一次村子又减少了一些任务，从各地抽调了一些人手在村子集结，为前线补充新鲜血液，这次主要是往草隐村的战场上输送兵力，岩隐的人数远超木叶，战争已经焦灼有一段时间了，木叶这边就是一个字‘拖’，等跟云隐那边结束了，才是集结力量反攻的时候。
岩隐村也不好过，他们不但要跟木叶打，还有木叶的盟友，砂隐村也以三代风影失踪为借口，开始进攻岩隐的忍者大军，可以说也是双线作战，灼遁叶仓就是在跟岩隐的对战中闯出的名声，四代风影罗砂将她打造成了砂隐的英雄。