正式官衔为总督直隶、保定顺天等处地方军务、民政、钱粮、管理河道兼巡抚事。
万历皇帝把北直隶、保定、顺天府权力全交给庞尚鹏，他的权力比各地总督、巡抚还要大很多，敕令在天津卫建造直隶总督府。
四月初三，再次廷议。
万历皇帝封戚继光为定边伯，调回京城任中军都督府左都督，提督五军都督府事，万历皇帝的意思很明白，封伯闲用。
封李成梁为安西伯，由辽东总兵调大同总兵，李平胡为大同副总兵、曹黻为大同副总兵。
升骆尚志为都督佥事，任蓟镇总兵。
升吴惟忠为都督佥事，任辽东总兵。
升董一奎为五军都督府右都督，即刻进京。
升麻锦为五军都督府右都督，即刻进京。
升杨四畏为中军都督府右都督，特进荣禄大夫，即刻进京。
升董一元为中军都督府都督佥事，任宣府总兵。
调宁夏副总兵哱拜，为宣府副总兵。
升麻贵为后军都督府都督佥事，任宁夏总兵。
山西镇总兵调陕西镇总兵。
陕西镇总兵，调宁夏镇总兵。
延绥镇总兵，调山西镇总兵。
延绥镇副总兵升为总兵。
万历九年，四月。
各种升职、调令从朝廷出发，五月初李成梁带着辽东六千家丁到大同镇上任。
李成梁心里清楚，万岁爷在为打大仗谋划，如果他在辽东不动，或者不带着大批家丁到大同上任，那么他就会被夺官。
五月初二，庞尚鹏正式在天津卫总督衙门办公。
五月初三，海瑞任左督御史。
各地大军调动，这次调动，人员几乎没有变化，有些类似后世军区换防。
这次大明九边总兵大调换，这也是保护武将的一种方法，万历皇帝不想让武将和文官牵扯太深。
戚继光、杨四畏、麻锦、董一奎这些人到京城的五军都督府，一是让他们清点京营士兵数量，二是让他们养老。
杨四畏就是杨元的父亲。
麻锦是麻贵的哥哥。
董一奎是董一元的哥哥。
五月初六，升任大同知府魏允贞为大同巡抚，挂佥都御史衔。
五月初七，敕令都察院左督御史海瑞，吏部尚书王国光主持京察。
五月初九，敕令五军都督府清查京营士兵数量。
五月十一，蓟辽总督梁梦龙、山西巡抚辛应干、山西布政使、兵部左侍郎吴兑等三十七人，贪赃枉法，侵吞赈灾粮、克扣军饷、吃兵饷等，着押解京城，敕令都察院、大理寺、刑部审讯定罪。
五月十七日，升叶梦熊兵部左侍郎、右都御史、蓟、辽总督。
五月，二十六日，都察院御史弹劾徐阶，侵占百姓田地四千顷，徐家子弟鱼肉百姓，敕令南京都察院，南京镇守太监田义，押解徐家一百三十七口到京。
五月，二十八日，敕令都察院、大理寺、刑部审讯徐阶家族霸占松江府百姓田地案。
六月初一，万历皇帝封中军都督府左都督马芳，靖北伯，命礼部议谥号。
六月初三，派程任卿协办京察事宜。
六月初五，任命帅嘉谟、安远武、李兵署理税务局。
六月初七，近卫军新兵到齐。
近卫军一团团长杨元。
近卫军直属团团长马林。
近卫军骑兵团团长李如松。
近卫军炮兵团团长胡志远。
近卫军二团团长吴杰文。
近卫军三团团长郑雷。
近卫军一团、近卫军炮兵团，军营驻扎西山。
近卫军直属团、近卫军二团，军营驻扎大兴。
近卫军骑兵团，军营驻扎丰台。
近卫军三团，军营驻扎通州。
近卫军侦查营，军营驻扎清河。
近卫军一团、直属团各三千三百人。
近卫军骑兵团，总人数三千两百人。
近卫军炮兵团，总人数两千八百人。
近卫军二团、三团各三千两百人。
近卫军侦查营，总人数八百三十六人。
近卫军总人数：一万九千八百三十六人。