大明设置的十三个省级行政区，山东、山西、河南、陕西、四川、江西、湖广、浙江、福建、广西、广东、云南、贵州十三个布政使司。
每个省都有巡抚，而且每个巡抚都挂都察院御史衔，大明设置巡抚，就是为了监察各省布政司、都司、按察司管理地方民政。
大明两京一十三省，北直隶顺天府，南直隶有应天府，北直隶管辖后世京城、河北、天津、以及河南、山东小部分。
南直隶管辖有后世江苏、安徽、上海等，南京有六部、九卿、都察院等，成祖永乐时期政治中心北移，南京作为陪都，一直保持行政职权，不过六部、九卿、都察院的官员，并不齐全，南京的皇宫，也已经很多年没有修缮。
十三省中，如山东，此时管辖着辽东，大明的陕西包括了后世甘肃和宁夏，湖广则是后世的湖南湖北两个省，四川包括了重庆。
如果不算羁縻，汉、唐没有大明实际统治面积大，后世人们津津乐道的改土归流，则是太祖洪武时期推行，永乐时期达到巅峰，宣德、正统时期有所收缩，后世的雪区、黑、吉属大明羁縻，永乐时期设置奴儿干都司，雪区设置乌斯藏都司。
大明两京、一十三省、一百六十个府、一百九十三个州、一千四百二十七个县，这只是民政部门，还有九边、京师三大营，以及无数的卫所，另外还有漕运、河道、督粮道、一百多个兵备道。
这么多官员，就算再精干的皇帝，也不能知道他们具体的成绩，如果一个地区安静无事，税收没有太大亏空，该地区的民风就是醇厚。
每个人都不是单独的个体，有人的地方就会有江湖，何况庙堂之上，朝廷之上？
官员出自同一个省、同一个府、或者同一个县，这就是乡谊，这也是后来人们攻击张居正是楚党的原因，如工部尚书曾省吾，他与张居正籍贯都是湖广，春秋战国时期湖广乃楚国之地，这也是古人的地域攻击，楚党也并非都是出自湖广的，因张居正当权，朝中官员投靠之，有共同的利益诉求。
年谊，就是同一年考中举人或进士，他们的情谊就像学校里的同学，主考官就是他们的老师，大多都互相观照。
还有一种就是姻谊，如张四维与前内阁辅臣马自强，张四维的女儿嫁马自强的儿子马怡，张四维的儿子张泰征娶杨博的孙女，杨博隆庆六年吏部尚书。
这些谊，就是形成文官派系原因，文官虽有各部院组织，又有各自的派系，大明此时的官场就是这种公私阴阳的状态，不止此时的大明，后世各国都如是一样。
朱翊钧不是理想家，他深知人类的弱点，没有派系的官场不可能，如何调和阴阳，就看皇帝以及内阁如何操作。
书中自有黄金屋，书中自有颜如玉。
读书人想要拥有黄金屋，就要参加科举，目的就是当官，如一分不拿，一分不占的官员有，很少，凡事都要有一个度，人类社会就是人情社会，古今中外都一样，大明给官员的工资很少，勉强温饱尚可，官员要想体面，要想活的潇洒一些，就要拿一些，占一些，朱翊钧也会理解他们，如果有人贪得无厌，那么就要稍加惩治，严重者他也会杀鸡儆猴。
想要拥有颜如玉，就要有功名、有官位、还要有银钱，这些都有了，颜如玉会主动送上门。
此时大明不太重视法律，这也是朱翊钧不能按照《大明律》处置官员的原因，此时大明从朝廷到地方，所有官员以伦理道德自居，凡事问迹不问心，现在伦理道德占据高地，官员凭着良心做事，百姓苦不堪言，朱翊钧虽然反对张居正在北方推行一条鞭法，不过他赞同张居正推行考成法。
朱翊钧并不想成为一个因自己好恶惩罚官员的皇帝，杀人容易，让众人宾服很难，四书五经提倡读书人节俭，可是每个人都有私欲，大明又有几个能做到海瑞这样？
理想主义虽然很好，也是百姓的福分，如果大明有十几个海瑞，每人管理一省，那么大明百姓永远不会推翻大明，可是这现实吗？
百官让朱翊钧节俭，他已经做到几分，裁撤宫里宦官和宫女，又减少宫内一切用度，百官是否像张居正一样双标？让皇帝做表率，自己铺张浪费，奢华无度？
大明的官员任命，大部分由廷推决定，内阁、吏部、都察院、还有朱翊钧本人，决定山西官员人选的问题。
大明的廷推，由文官和皇帝决定，朱翊钧也不能决定官员的人选，他想任命官员，只能找他们商议，官员不由廷推而进者，这是不合法的，朱翊钧可以赏赐季伯常为锦衣卫百户，这是因为锦衣卫是皇帝的私人护卫。
廷推由吏部尚书王国光主持，朱翊钧坐在椅子上，内阁和都察院分左右而立，廷推并不适用于内阁大臣，因为内阁在名义上，属于皇帝的秘书班子，司礼监是私人秘书班子，廷推也不能由内阁和皇帝决定，大明官员十分看重廷推，由吏部会同都察院、九卿共同廷推，没有九卿也可以。
不过皇帝不能中旨任命官员，内阁也不能推用官员，这样会导致很多议论，弊病也很严重，不由吏部而得职位，往往会被排挤，官员也会感觉羞耻。
吏部尚书王国光把廷推的名单公布出来，一般一个职位，会有两三个人选，这些人选由皇帝勾选，再由大臣们商议，最后廷推出结果，公布出来。
朱翊钧对官员任命感兴趣，不过他要压制自己的欲望，现在大明官员任命，还是由张居正决定。
张居正经常以私人函件的形式，授意他亲信的总督、巡抚，要他们如此如此上奏，然后张居正以内阁大学士的身份，票拟批准自己的建议，为了鼓励自己的亲信，有时还会给亲信的函件上暗示，这种做法确实有些不妥，这些事在其他官员眼中，就是上下其手，培植自己私人势力。
想要做事，培养自己的私人势力，朱翊钧认为没有什么，大明幅员辽阔，想要做事就要有人去实施，不过张居正这种强权做法，对他与他的亲信是良法，对整个大明官场，有害无益。
各省与各省的情况不一样，推行政策不能一刀切，各府、各县行政效率的增进，必然是缓慢的，有些事五年可以做成，利用强权一年完成，就会有很多弊病，强求效率曾高，就会造成各府、各、州、各县的不安，造成整个文官集团的分裂，最后搞来搞去，还是转到伦理道德问题。
张居正要求朱翊钧节俭，可是他本人奢华无度，这些事官员都看在眼里，他有权力时，很多官员就弹劾他，邹元标弹劾张居正，被打折一条腿，发配到贵州。
还有魏允贞也上疏弹劾张居正，这些人都在攻击张居正的私德，而张居正的私德，确实做的不好，张居正要求其他官员节俭，但是他不能以身作则，这当然会给人口实，这也是张居正倒台后，很多人都参与清算的原因。
朱翊钧并不想清算张居正，如果他清算张居正，以后谁还会为朝廷做事？