说到底，崇祯南渡以来，并没有办法改变大明朝一直以来的党争问题，双方固然在崇祯面前不能撕破脸，可是针对互相下黑手却是并没有什么心理上的问题，特别是南方基本上都是东林一党的底盘，他们一方面想要打击京师一派的力量，一方面对南方的阉党势力同样不会手软。
总之，如今聚集在南京的东林-复社一派官僚们始终都打着一个如意算盘，一来是趁着北都沦陷，将那些没有跟着南下的官员们打成‘从贼逆党’，将那些南下的少数官员实施孤立政策，而另一方面坚决抵制那些在野士绅重新入仕，特别是阉党一派的余党更要严防死守，，这样可以为自己控制从中央到地方的全部要津铺平道路。
很不幸的是，阮大铖就是东林君子们眼中大大的阉党，而这件事则是要牵扯到崇祯刚刚继位的时候，当时魏忠贤刚刚垮台，朝廷上两派势力的争斗尚未明朗化，而这个时候阮大铖急于入朝做官，便想了一个投机取巧的招数。
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什么招数呢？其实说白了并不新鲜，他专门草拟了两份内容完全不一样的奏疏，一封是专门攻击以魏忠贤为首的阉党，另一方面则是专门攻击东林清流，他老人家想得倒是挺好，看哪边快败了，就把攻击该党的奏疏拿出来捞取机会。
关键是就在于阮大铖所交非人，他派人把疏稿送往北京请友人杨维垣相机行事，可没想到杨维垣转过头来就把他卖掉了，即将前一封攻击阉党的奏疏拿给自己用了，而把攻击东林的奏疏代替阮大铖呈递了上去，这一下子使得东林人士为之大哗，阮大铖因此被列入逆案第三等，永不叙用。
至此，阮大铖只能借寓南京编演新戏，交结朋友，声歌自娱，可是没想到东林的后辈们欺人太甚，还专门写了一篇《留都防乱公揭》广泛征集清流签名，而这一篇文章的矛头便对准了阮大铖，使得阮大铖的名声彻底一片狼藉。
后来的，到了崇祯十四年时，周延儒在部分东林党的支持下，通过重贿司礼监太监的方式，重新当上了首辅，而这个过程中，作为阉党的冯铨和阮大铖也参与了筹集贿金，只为了东山再起。
本来周延儒的确准备起复冯铨和阮大铖，可是受到了东林的集体反对，碍于东林骨干的要挟下，他只能采取折中的办法，将阮大铖的同年好友原宣府巡抚马士英起复为凤阳总督，而马士英当年也是一个老倒霉蛋了。
原因很简单，马士英本身也是东林出身，他在政治态度上其实比较倾向于东林和复社，跟钱谦益、陈子龙、夏允彝等人关系还不错，不过他政治上并不顺利，在崇祯五年的时候擢右佥都御史，巡抚宣府，结果刚刚当上了这个官以后，他就挪用了公款来贿赂朝廷当中的权贵，结果被镇守太监王坤所举报，然后官没当成，落了一个遣戍的结果。
不过说起来这也是当时的官场惯例，东林众人并不认为这是一个过错，只觉得是阉党们的构陷，还曾经为马士英上书愤愤不平过，只可惜没什么用。
于是，当马士英得到阮大铖的推荐重新成为凤阳总督的时候，他自然对阮大铖感激不尽，一心想着要报答对方，便存心要起复此人。
如果放在往日里，朝廷里有东林君子们挡着，马士英一个地方督抚也没啥好办法，可是眼下崇祯要让他去经略河南，这可不是一件非同小可的事情，很有可能会顺水推舟起复阮大铖，到时候只怕牵出萝卜拔出藤，其他这些阉党大臣也会跟着一起起复，到时候东林君子们可就傻眼了。
因此，眼下东林君子们自然是强烈反对让马士英出镇河南，甚至攻击其为阉党张目。
眼见得朝廷群情汹汹之际，崇祯再一次见识到了东林们的强大，他微微皱了皱眉头，道：“若是不用马士英，由谁来代替他呢？”
听到崇祯的问话，朝廷内却陷入了一阵沉默，毕竟对于东林大臣们而言，他们本身都是袖手空谈的君子，怎么能亲自下场去做事呢？到时候做成了固然好说，要是没做成，那可就麻烦了.......